燃油稅費改革牽涉多方利益，備受社會各方面關注，醞釀多年始終未能推出。2008年李克強擔任此項改革領導協調小組組長后，確定了公平稅賦、正稅清費的原則，組織制定新的改革方案，統籌價稅費聯動改革，抓住稍縱即逝的改革機遇，果斷決策實施。不僅減輕了消費者不合理負擔，促進了節能減排，更重要的是形成了以市場為基礎的價格形成機制，并為其他改革創造了經驗。

2012年，李克強親自“督陣”營業稅改征增值稅試點工作，深入一線調研，開會研究方案，重點解決制約經濟發展的稅費問題。在上海取得成效，特別是服務業、小微企業稅負大幅減輕后，又力推將試點擴大到9個省（市），不僅實現了重大制度創新，而且以結構性減稅促進了“穩增長、調結構、惠民生”的戰略性目標。

“十二五”規劃是中國經濟社會發展的宏偉藍圖，不僅包括總體規劃綱要，還有近百個專項規劃，涉及部門多，政策性強，是個龐大的系統工程。李克強長期主政地方農業、工業大省，到中央工作后，又分管發展改革、財政、城鄉建設、環境保護、國土資源、衛生等經濟社會領域的工作，使他對中國的國情深諳于心，對中國經濟社會發展的潛力、機遇以及面臨的挑戰了然于胸。他在領導和指導中國“十二五”規劃的制定中，多次到各地及各部門考察調研，分片主持召開“十二五”規劃綱要草案編制工作座談會以及服務業、能源等專項規劃編制座談會，廣泛聽取地方、專家、企業等各方面的意見建議，組織力量對擴大內需長效機制、縮小城鄉差距總體思路、城鎮化發展路徑模式、穩步提高人民生活水平等重大問題進行深入研究。經過兩年多的時間，一份備受國人期待、廣受世界關注的“十二五”規劃終于面世。美國諾貝爾經濟學獎得主邁克爾·斯賓塞稱：“‘十二五’規劃是一項非常復雜但極有條理的計劃，如果得到有效的實施，在未來一段時間里，在改變經濟增長模式、調控全球經濟的過程中，中國將在世界上扮演最最重要的角色。”約瑟夫·斯蒂格里茨說：“中國的‘十二五’規劃，代表了中國在經濟發展過程當中繼續轉型的方向。其中的中心任務就是一個新的開放的中國，新的融入世界的中國。在這個過程當中會有新的責任、新的機會出現，包括積極地參與到塑造全球經濟格局的過程當中。”美國哈佛大學經濟學教授馬丁·費爾德斯坦則評價：“中國的新五年規劃將對全球經濟產生極其重要的影響，它的主要特點是對官方政策進行調整，將原本的著眼于GDP增長的最大化，轉變為提升消費以及勞動者的平均生活水平。”

食品安全是涉及眾多部門的復雜民生問題，李克強始終牽掛于心。2010年，他出任國務院食品安全委員會主任后強調：食品安全事關每個家庭每個人，必須重典治亂、重拳出擊，讓不法分子付出高昂代價。此后，國務院采取了一系列重大舉措，把食品安全工作納入地方政府績效考核，實行一票否決；督促各地各部門加大工作力度，出現苗頭就打，及時處理了一連串重大案件，使食品安全日益惡劣的局面出現好轉跡象。

2009年初，一場突如其來的新型呼吸系統傳染病——甲型流感席卷全球，世界衛生組織將應對級別上升到最高級。在美洲爆發后沒多久，這種病就迅速通過種種渠道傳入中國，社會民眾情緒再次陷入類似2003年SARS爆發時的緊張氛圍之中。在這種情況下，李克強果斷決定，啟動應對甲型流感聯防聯控工作機制，協調各方面力量，多策并舉，多管齊下，專群結合，加大疫苗研發生產進度，既有力有效地控制了疫情傳播，又盡可能地不影響群眾生活和正常經濟活動，取得了抗擊甲型流感的重大勝利，也為中國應對突發公共衛生事件創造了成功的典范。

李克強在國務院主持常務工作，經常會遇到棘手難題，但他從不回避，也不張揚，妥善化解矛盾于無形。他分管的眾多領域所面臨的復雜問題，有很多被公認為“世界性難題”。特別是當下改革漸入深水區，各方利益訴求錯綜復雜，牽一發而動全局。解開這些“難題”，不僅需要過人的勇氣和膽略，同時還需有開闊的視野和系統的知識儲備。從地方到中央，李克強一一化解了不少這樣的“難題”，被境外媒體稱為“破解復雜難題的高手”。